Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
HOXD1Q9GZZ0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
HOXD1Q9GZZ0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
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