Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU3

TMEM39B, Transmembrane protein 39B, humanhuman

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM39BQ9GZU3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TMEM39BQ9GZU3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TMEM39BQ9GZU3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMEM39BQ9GZU3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.2 ms