Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT8

NIF3L1, NIF3-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIF3L1Q9GZT8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NIF3L1Q9GZT8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
NIF3L1Q9GZT8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms