Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K0

BCL11B, B-cell lymphoma/leukemia 11B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCL11BQ9C0K0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BCL11BQ9C0K0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BCL11BQ9C0K0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms