Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C9

UBE2O, (E3-independent) E2 ubiquitin-conjugating enzyme, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2OQ9C0C9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2OQ9C0C9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBE2OQ9C0C9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms