Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SEMA4CQ9C0C4 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA4CQ9C0C4 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA4CQ9C0C4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms