Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CNTNAP4Q9C0A0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CNTNAP4Q9C0A0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms