Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
INO80BQ9C086 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
INO80BQ9C086 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms