Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SMIM3Q9BZL3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms