Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SALL3Q9BXA9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SALL3Q9BXA9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
SALL3Q9BXA9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms