Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWF2

TRAIP, E3 ubiquitin-protein ligase TRAIP, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAIPQ9BWF2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRAIPQ9BWF2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRAIPQ9BWF2 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms