Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP58Q9BVL2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUP58Q9BVL2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms