Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG3

TRIM62, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM62, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM62Q9BVG3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM62Q9BVG3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRIM62Q9BVG3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms