Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV29

CCDC32, Coiled-coil domain-containing protein 32, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC32Q9BV29 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC32Q9BV29 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms