Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TRAF4Q9BUZ4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TRAF4Q9BUZ4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms