Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT76

UPK3B, Uroplakin-3b, humanhuman

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BQ9BT76 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
UPK3BQ9BT76 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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