Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSG0

PRADC1, Protease-associated domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1Q9BSG0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PRADC1Q9BSG0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PRADC1Q9BSG0 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms