Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NIPSNAP3BQ9BS92 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NIPSNAP3BQ9BS92 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms