Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LINC00467Q9BRT7 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LINC00467Q9BRT7 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms