Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SLF1Q9BQI6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLF1Q9BQI6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms