Protein–RNA interactions for Protein: Q99988

GDF15, Growth/differentiation factor 15, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF15Q99988 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GDF15Q99988 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GDF15Q99988 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms