Protein–RNA interactions for Protein: Q99675

CGRRF1, Cell growth regulator with RING finger domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGRRF1Q99675 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CGRRF1Q99675 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CGRRF1Q99675 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms