Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF6Q99612 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF6Q99612 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF6Q99612 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF6Q99612 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF6Q99612 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF6Q99612 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF6Q99612 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF6Q99612 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF6Q99612 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF6Q99612 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KLF6Q99612 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KLF6Q99612 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms