Protein–RNA interactions for Protein: Q99608

NDN, Necdin, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDNQ99608 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNQ99608 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNQ99608 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
NDNQ99608 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NDNQ99608 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDNQ99608 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDNQ99608 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDNQ99608 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDNQ99608 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDNQ99608 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
NDNQ99608 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDNQ99608 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDNQ99608 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDNQ99608 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDNQ99608 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
NDNQ99608 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
NDNQ99608 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NDNQ99608 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NDNQ99608 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NDNQ99608 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NDNQ99608 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNQ99608 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNQ99608 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNQ99608 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNQ99608 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNQ99608 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNQ99608 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNQ99608 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNQ99608 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NDNQ99608 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms