Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
VAT1Q99536 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
VAT1Q99536 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms