Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EYA3Q99504 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EYA3Q99504 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms