Protein–RNA interactions for Protein: Q99456

KRT12, Keratin, type I cytoskeletal 12, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT12Q99456 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRT12Q99456 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRT12Q99456 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms