Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
YME1L1Q96TA2 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
YME1L1Q96TA2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms