Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PNKPQ96T60 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PNKPQ96T60 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms