Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RUFY1Q96T51 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RUFY1Q96T51 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms