Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CSRNP1Q96S65 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CSRNP1Q96S65 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms