Protein–RNA interactions for Protein: Q96RT6

CTAGE1, cTAGE family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTAGE1Q96RT6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CTAGE1Q96RT6 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CTAGE1Q96RT6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CTAGE1Q96RT6 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms