Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TGS1Q96RS0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TGS1Q96RS0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms