Protein–RNA interactions for Protein: Q96QH2

PRAM1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAM1Q96QH2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
PRAM1Q96QH2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PRAM1Q96QH2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms