Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CMTM3Q96MX0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CMTM3Q96MX0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms