Protein–RNA interactions for Protein: Q96MK3

FAM20A, Pseudokinase FAM20A, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM20AQ96MK3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM20AQ96MK3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM20AQ96MK3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms