Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
NSMCE2Q96MF7 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
NSMCE2Q96MF7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms