Protein–RNA interactions for Protein: Q96MC4

CEP295NL, CEP295 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP295NLQ96MC4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CEP295NLQ96MC4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CEP295NLQ96MC4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms