Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CCDC114Q96M63 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CCDC114Q96M63 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms