Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ALPK3Q96L96 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ALPK3Q96L96 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms