Protein–RNA interactions for Protein: Q96K49

TMEM87B, Transmembrane protein 87B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87BQ96K49 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TMEM87BQ96K49 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM87BQ96K49 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM87BQ96K49 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.3 ms