Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
LRIG1Q96JA1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LRIG1Q96JA1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms