Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CELF6Q96J87 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CELF6Q96J87 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF6Q96J87 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CELF6Q96J87 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms