Protein–RNA interactions for Protein: Q96J66

ABCC11, ATP-binding cassette sub-family C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC11Q96J66 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ABCC11Q96J66 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.4
ABCC11Q96J66 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC30■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC30■■■□□ 2.39
ABCC11Q96J66 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms