Protein–RNA interactions for Protein: Q96HD1

CRELD1, Cysteine-rich with EGF-like domain protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRELD1Q96HD1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
CRELD1Q96HD1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CRELD1Q96HD1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms