Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LTV1Q96GA3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
LTV1Q96GA3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LTV1Q96GA3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms