Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
MRPL53Q96EL3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms