Protein–RNA interactions for Protein: Q96E11

MRRF, Ribosome-recycling factor, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRRFQ96E11 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
MRRFQ96E11 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MRRFQ96E11 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms