Protein–RNA interactions for Protein: Q96D59

RNF183, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF183, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF183Q96D59 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
RNF183Q96D59 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RNF183Q96D59 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms