Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MKL1Q969V6 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MKL1Q969V6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms